王利媛

研究兴趣

1. 植物病原菌如何利用表观遗传机制调控效应基因表达，以逃避寄主识别/增强自身致病力。
   组蛋白修饰；小RNA；mRNA NAD⁺帽子修饰；DNA修饰等。
2. 人工智能在生物信息学中的应用。

教育工作经历

• 2021/08–至今   上海交通大学农业与生物学院   博士后/助研（合作导师：侯英楠）
• 2015/09–2021/06   南京农业大学植物保护学院   硕/博士连读（导师：董莎萌）
• 2019/01–2020/09   加拿大农业部伦敦研发中心   公派联合培养（导师：Mark Gijzen）
• 2014/05–2014/08   中国水稻研究所   毕业实习（导师：侯雨萱）
• 2011/09–2015/06   浙江农林大学农业与食品科学学院   农学学士（导师：饶琼）

论文发表

1. Effector gene silencing coordinated by histone methylation and small RNAs enhances host adaptation in a plant pathogen. (投稿阶段, 第一作者兼共通讯)
2. Candy or poison: plant metabolites as swing factors against microbes. 2024, Molecular Plant (IF₂₀₂₃=17.1). 第一作者, spotlight
3. Effector gene silencing mediated by histone methylation underpins host adaptation in an oomycete plant pathogen. 2020, Nucleic Acids Res. (IF₂₀₂₃=16.6). 第一作者
4. scGO: interpretable deep neural network for cell status annotation and disease diagnosis. 2025, Brief Bioinform. (IF₂₀₂₃=6.8). 共一第三
5. Simultaneous profiling of ac4C and m5C modifications from nanopore direct RNA sequencing. 2025, Int. J. Biol. Macromol. (IF₂₀₂₃=7.7). 第四作者
6. Phytophthora methylomes are modulated by 6mA methyltransferases and associated with adaptive genome regions. 2018, Genome Biol. (IF₂₀₂₃=10.1). 第三作者
7. JMJ704 positively regulates rice defense response against Xanthomonas oryzae pv. oryzae infection via reducing H3K4me2/3 associated with negative disease resistance regulators. 2015, BMC Plant Biology. (IF₂₀₂₃=4.3). 第二作者

主持项目

• 国家自然科学基金青年项目，32400164，2025-01至2027-12，在研。
• 中国博士后科学基金面上项目，2022M712097，2022-01至2023-08，已结题。

学术兼职

• Genomics Communication 青年编委

获奖情况

• 2022.12｜上海市遗传学会青年论坛优秀海报奖
• 2022.12｜2022年江苏省优秀博士学位论文
• 2022.06｜南京农业大学2022年校级优秀学位论文
• 2022.05｜上海交通大学2021年度“晨星博士后激励计划”
• 2021.06｜南京农业大学2021届优秀毕业生
• 2020.12｜南京农业大学2020年度最具影响力研究生（年度共10名研究生获选）
• 2020.12｜2020年南京农业大学研究生学术科技作品竞赛一等奖（自然科学类博士组一等奖共2人）
• 2020.06｜南京农业大学2020年度校长奖学金（年度共8名博士生获奖）
• 2019.01｜中化农业MAP奖学金（年度共8名研究生获奖）
• 2018.04｜第19届Oomycete Molecular Genetics Network Meeting最佳海报奖（年度共3人）

掌握技能

1. 卵菌遗传转化技术，包括大豆疫霉、辣椒疫霉以及致病疫霉，可做敲除、回补、替换和过表达。
2. 分子生物学实验，包括 RT-qPCR、Western-blot 等常规实验以及 ChIP-seq、NAD-seq、GMUCT 等文库构建。
3. 生物信息学分析，包括 RNA-seq、small RNA-seq、ChIP-seq、NAD-seq、降解组测序流程分析及作图。